צמחי מרפא בקבוצה זו מטפלים בבעיות נפוצות בכליות ובדרכי השתן.
נהוג לחלק את הקבוצה ל4 קטגוריות עיקריות להלן:
1. משתני נפח – קבוצה זו מגבירה את נפח השתן המופרש ע"י המרצת פעילות הכליות ובאופן זה הצמחים עוזרים להפריש עודפי נוזלים. נרצה להשתמש בהם בעיקר לטיפול בבצקות וביתר לחץ דם, ולעתים גם בדלקות כרוניות של דרכי השתן, כאשר במקרה זה מטרת הטיפול היא "שטיפה" של הכליות ודרכי השתן.
2. משתנים מטבולים – צמחים בקטגוריה זו אינם בהכרח מגבירים את כמות השתן המופרש, אלא הם משנים את איכותו, ולמעשה הם מסייעים להפרשת תוצרי לוואי ורעלים המגיעים לגופנו דרך האוכל, האוויר, המים, התרופות וכדומה. פעילות הצמחים בקבוצה זו עמוקה יותר בהשוואה למשתני הנפח, והרבה פעמים מטפלים משייכים את הצמחים האלו לקטגורית הצמחים האלטרטיביים (מתמירים ראה כאן).
3. משתנים אנטיספטיים – עיקר פעילות הצמחים בקטגוריה זו הינה חיטוי כל דרכי השתן. החומרים הפעילים שישנם בצמחים אלו הינם בעלי פעילות אנטי בקטריאלית יעילה בעלי כושר חיטוי גבוה ויודעים לנוע במיוחד לאזור דרכי השתן. וכך הם מחסלים מיקרואורגניזמים פתוגניים במערכת זו.
4. משתנים מאלחשים ומסלקי אבנים – צמחים אלו למעשה מסייעים בסילוק אבנים מדרכי השתן, וכן הם מאלחשים את דרכי השתן דבר אשר מסייע לטיפול הן בסילוק האבנים והן לדלקות בדרכי השתן.
הערה חשובה: אבנים שגודלן קטן מ-5 מ"מ הנמצאות בכליה או בדרכי השתן אינן דורשות, בדרך כלל, הליך רפואי מיוחד, וניתן להסתפק בטיפול מונע כגון שתייה רבה של מים מטוהרים, דיאטה בעלת Ph בסיסי וצמחי מרפא לסילוקן.
כאשר האבנים הכלואות גדולות מ-6 מ"מ יש לשקול בכובד ראש טיפול צמחי ומומלץ לעשות זאת רק עם מטפל מוסמך.